FastPCR(PCR引物设计软件)

FastPCR是一款简单易用，功能强大的PCR引物设计软件。它为用户提供了一个集成的工具环境，为设计任何类型的PCR引物提供全面而专业的设计辅助工具，可用于分析硅片，pcr集成工具环境，PCR引物或探针设计等场合，包括各种生物信息学工具，还具备处理长序列和核酸或蛋白质序列组的能力，功能非常丰富，有需求的用户请下载安装！

软件功能

1、FastPCR软件是一个集成的工具环境，为设计任何类型的PCR引物提供全面而专业的设施，用于标准，长距离，反向，实时PCR（LUX和自我报告），多重PCR，Xtreme Chain Reaction（XCR），组特异性（用于遗传相关DNA序列的通用引物）或独特的（来自遗传相关DNA序列的特异性引物），重叠延伸PCR（OE-PCR）多片段组装克隆和LAMP（环介导的等温扩增）; 单引物PCR（从密切定位的反向重复序列设计PCR引物），自动检测SSR基因座和直接PCR引物设计，氨基酸序列简并PCR，聚合酶链装配（PCA），平铺感兴趣区域的设计扩增子以及更多。

2、“ 计算机模拟”（虚拟）PCR引物或针对全基因组的探针搜索或计算机模拟PCR或可能的PCR产物的染色体预测列表以及搜索指定引物或探针的潜在错配位置。在一定范围内同时搜索多个目标。“ in silico ”寡核苷酸搜索有助于通过温度熔解和PCR退火温度计算发现靶结合位点。

3、可以设计长寡核苷酸用于微阵列分析，并且可以设计用于探针的双标记寡核苷酸，例如分子信标。

软件亮点

1、综合引物测试，标准和简并寡核苷酸的熔解温度计算，引物的PCR效率和语言复杂性，稀释和重悬浮计算器。

2、分析所有引物二级结构的引物（探针），包括与Watson-Crick碱基配对的替代氢键，例如G / C-四链体或摆动碱基对（如GG，GT，GA），发夹，自身二聚体和交叉 - 引物对中的二聚体。该软件利用所有工具的正常和简并引物的组合，并且用于熔解温度计算基于最近邻热力学参数。

3、FastPCR具有处理长序列和核酸或蛋白质序列组的能力，它允许每个给定序列的单个任务和参数，并连接单个运行的几个不同任务。它还允许序列编辑和数据库分析。

4、通过可视化开发并应用于程序的各种类型重复的高效和完整检测。

5、该程序包括各种生物信息学工具，用于分析具有GC或AT偏斜的序列，CG％和GA％含量和嘌呤 - 嘧啶偏斜，语言序列复杂性; 生成随机DNA序列，限制性I-II-III类型酶和归巢核酸内切酶分析，找到或创建编码序列的限制酶识别位点，并支持序列聚类和共有序列生成以及序列相似性和保守性分析。